Расположенная на западе Подмосковья, деревня отстоит на 51 км от Московской кольцевой автодороги.
В радиусе 7 километров от деревни расположены разновеликие по численности населения поселения. В 7-ти километровой зоне от деревни располагаются посёлки: пансионат "Полушкино", дом отдыха "Тучково" ВЦСПС, детского городка "Дружба", деревни: Никифоровское, Васильевское, Бережки, Алтыново. Рядом с деревней (в пределах километра) стоит дер. Васильевское. Наиболее крупным можно назвать пос. пансионат "Полушкино" (зарегистрировано 456 жителей).
Районным центром является город Одинцово, который располагается в 44,4 километрах к востоку от деревни Агафоново.
В свою очередь, цены на недвижимость в деревне Агафоново выше в 1,1 раза среднеобластного уровня для такой удалённости от Московской кольцевой автодороги. Предложения недвижимости в этой зоне более всего устраивает граждан со средним достатком.
Неподалёку от деревни расположены участки СНТ «Экипаж», «Медик», «Восход», «Армада». Среди них по ценности земель опережает других ДСК «Армада» ( рядом с дер. Агафоново ). С другой стороны, менее дорогими участками можно поинтересоваться в СТ «Экипаж» ( что тоже рядом с дер. Агафоново ).
Не далее 15 км от деревни Агафоново соседствует единственный котт. посёлок - „Москварека-Васильевское“:
Агафоново стоит поблизости, в 7 -км, с Можайской трассой. Аналогично до деревни можно добраться по Минскому шоссе.
Железная дорога Смоленского направления соединяет деревню с Москвой. До ближней ж/д платформы Полушкино примерно четыре километра.