Расположившееся в юго-восточной части Мособласти, село отдалено на пятьдесят четыре километра от МКАД.
Село окружают разновеликие по плотности застройки поселения. Ближайшие к селу населённые пункты: сёла: Щапово, Хонятино, деревни: Белыхино, Буньково, Щапово, Ламоново, Глебово. Недалеко от села стоит дер. Щапово. Самым заметным можно назвать с. Хонятино (зарегистрировано 142 жителей).
Административным центром является город Ступино, расположенный в 31,4 километрах к югу от села Нефедьево.
Стоимости домов и земельных участков в селе Нефедьево - отстают на 56 процентов от средневзвешенного по Московской области значения (для такого удаления от Москвы). Этот ценовой сегмент, как правило, привлекает людей с ограниченными финансовыми возможностями. Общее количество предложений недвижимости по Ступинскому району находится на среднем по области уровне (около 3 %).
Совсем рядом находятся участки СНТ «Буньково», «Монолит», «Березки», «Мичуринец-3», «Астра-2», «Ламоново-2», «Мичуринец-1», «Россиянка», «Нефедьево», «Факел». Из соседних дач по цене земли всех превосходит СТ «Ламоново-2» ( вблизи дер. Ламоново ). Добавим, что самыми недорогими обладает СТ «Нефедьево» ( что вблизи с. Нефедьево ).
Из отчётов Роскадастра за 2013-2016 гг.:Распостранённая структура земельных участков - территории населенных пунктов, выделяемые для личных подсобных хозяйств. Наибольшая зафиксированная кадастровая оценка участков считается 121 900,0 рублей за сотку. На основе информации кадастрового портала, пик сделок купли-продаж здешней недвижимости зарегистрирован в 2015, 2013 г. В основном случались купли-продажи неосвоенных земельных участков, при самой большой указанной стоимости продажи - 999 600,0 руб./объект ( участок 12 соток ). По размеру участков, особенно популярными были размеры в пределах 1200 - 1500 кв.м и 1000 - 1200 кв.м. Число объектов недвижимости со сроком нахождения в собственности больше трёх лет до продажи составил около 50% от всех зарегистрированных договоров. В части реализаций свободных участков, местная земля в целом превышает средне-статистический по Ступинскому району результат.
Нефедьево стоит всего в 6 -км от дороги A-108 (Московское Большое Кольцо). Также близкая к селу трасса - Каширская.
Доехать до села Нефедьево также можно по железнодорожной линии БМО. Ближайший железнодорожный пункт - станция Малино расположен в 6 км от села.