Деревня эта находится в юго-восточной части области на расстоянии семнадцати километров от Московской кольцевой автодороги.
Деревню окружают меньшие по численности населения населённые пункты. Неподалёку от деревни расположены деревни: Котляково, Вяльково, Воеводино, Жеребятьево, Красино, Татарское, Тупицино. Наиболее близкий к деревне населённый пункт - дер. Жеребятьево. Наиболее крупным из перечисленных можно назвать дер. Котляково.
Административным центром является город Домодедово, расположенный в 5,7 километрах к западу от деревни Шишкино. Прежде эта деревня подчинялась администрации Домодедовского района.
Цены на недвижимость деревни Шишкино и окружающей местности отстают на 22 процента от среднего значения, соответствующей удалённости от Москвы. Данный сегмент недвижимости может представлять интерес для людей , интересующихся предложениями в ближайшем Подмосковье. В целом Домодедовский район характеризуется небольшим количеством предложений недвижимости (менее 2 %).
В непосредственной близости от деревни находятся дачные посёлки «Отдых», «Рассвет», «Поляна-3», «Мираж», «ГАРТАЛ», «Лесок», «Шишкино», «Огонек», «Криптон», «Полет». Следует отметить, что по стоимости земель всех обгоняет СТ «Отдых» ( рядом с дер. Вяльково ). Также более дешёвыми предложениями обладает СТ «Полет» ( что рядом с дер. Шишкино ).
Из отчётов Роскадастра (2013-2017):Основная структура земель - земли населенных пунктов с разрешённым использованием ЛПХ. Наибольшая зафиксированная кадастровая цена участков считается 2 196 800,0 руб./8 соток. По сведениям из портала услуг регистрации и кадастра, наибольшая доля сделок местной недвижимости приходится на 2013 г. Главным образом превалировали реализации землевладений c несданными в эксплуатацию объектами, при самой большой указанной сумме договора - 6 700 000,0 руб./объект ( дом + участок 4 соток ). По размеру участков, наиболее предпочитаемыми были участки до 600 кв.м и 600 - 800 кв.м. Доля земельных объектов с периодом владения до трёх лет до продажи составил примерно 50% от всех проведённых сделок. По объёму реализаций участков c несданными в эксплуатацию объектами, данное место доминирует по Домодедовскому району .
Шишкино , можно сказать, примыкает к а/п Домодедовской трассе. Ещё близкие к деревне шоссе: Каширское, A-107, Симферопольское.
К деревне Шишкино подходит железнодорожная домодедовская ветка Павелецкого направления. Железнодорожная станция Космос находится в 4 км от дер. Шишкино.