Данная деревня расположена в западной части региона в тридцати одном километре от Московской кольцевой автодороги.
Деревню окружают меньшие по размеру поселения. Рядом с деревней находятся: село Дарна, посёлок Огниково, деревни: Холмы, Сысоево, Никольское, Алексино, Адуево. Ближе всего к деревне располагается дер. Сысоево. По плотности населения среди упомянутых всех превосходит пос. Огниково (проживает 162 жителей).
Административным центром является город Истра, расположенный в 8,7 километрах к юго-западу от деревни Духанино.
Для деревни Духанино цены на недвижимое имущество больше в 1,9 раза среднего по области уровня (для данной удалённости от МКАД) и представляет интерес в основном для людей , интересующихся предложениями с хорошей ликвидностью. В целом Истринский район характеризуется значительным объёмом предложений недвижимости.
Совсем рядом располагаются дачные объединения «завода Авангард», «Юбилейный-110», «Флора», «Строитель-1», «Сокольники-1», «Русь», «Росинка», «Родник», «Рассвет», «Полесье», «Пищемаш-2», «Пищемаш», «Никольское», «Минерал», «Меркурий», «Маяк». Округа деревни Духанино слывёт воистину дачным уголком. Здесь, в радиусе семи километров, построились приблизительно 30 дачных товариществ. А по стоимости земельных наделов выделяется СНТ «Флора» ( рядом с дер. Адуево ). Также самыми недорогими располагает СНТ «Минерал» ( что рядом с пос. Огниково ).
В 15-километровой зоне от деревни Духанино сосредоточено приличое количество (приблизительно 8 % для рассматриваемого направления) коттеджных застроек бизнес и эконом-класса. Известно, что Новорижское направление на аналогичном расстоянии от Москвы насчитывает 64 - коттеджных поселений. Продвинутое соседство выражено коттеджными поселениями с современной инфраструктурой, среди которых: «WESTERN», «Дарна», «Дачное», «Духанино-2», «Связист».
По сведениям кадастрового портала (2013-2017):Характерный статус участков - территории поселений, предназначенные для личного подсобного хозяйства. Самая большая зафиксированная кадастровая стоимость земельных участков считается 2 078 000,0 рублей за 10 соток. На основе информации портала услуг регистрации и кадастра, пик продаж местных недвижимых объектов установлен в 2014, 2013 г. В основном имели место покупки земельных участков c объектами незавершённого строительства, при самой большой задекларированной сумме сделки - 3 905 000,0 руб./объект ( дом + участок 10 соток ). По величине участков, наиболее покупаемыми были площади до 800 - 1000 кв.м и 12 - 15 соток. Время нахождения во владении объектов недвижимости до отчуждения обычно насчитывал больше трёх лет. По объёму сделок купли-продажи незастроенных соток и участков c объектами незавершённого строительства, деревня с ближней округой ниже среднего по Истринскому району значения.
Вблизи дер. Духанино (не далее 700 м) протекает река Песочная, общая длина которой насчитывает более, чем 28 километров, и которая является притоком р. Истра.
Также поблизости с деревней Духанино есть несколько водоёмов, в числе которых озеро Холмы, водохранилище Истринское. Более крупный водоём (водохранилище Истринское) имеет размер около 10.8 кв.км, располагается в 6.1 км северо-западее деревни, в направлении дер. Новораково, a у наиболее близкого (небольшой пруд, нет названия, располагается примерно в 900 м восточнее деревни, в направлении ДНП "Духанино-1") поперечный размер составляет где-то 90 м.
Недалеко от деревни (в 3 -км) проходит магистраль A-107 (Московское Малое Кольцо). Чуть дальше от деревни расположены трассы: Волоколамская и Новорижская.
Железнодорожное сообщение с деревней производится по по Большому кольцу Московской ж/д. До ближней ж/д станции «155 км» примерно четыре километра.
