Данная деревня находится в западной части Мособласти в тридцати одном километре от Московской кольцевой автодороги.
Деревня отличается плотностью населения на фоне соседних поселений. В радиусе 7-ти километров от деревни располагаются село Дарна, посёлок Огниково, деревни: Холмы, Сысоево, Никольское, Алексино, Адуево. Ближе всего к деревне располагается дер. Сысоево. По числу проживающих из названных выделяется пос. Огниково (зарегистрировано 162 жителей).
Административным центром является город Истра, находящийся в 8,7 километрах к юго-западу от деревни Духанино.
Цены на земли и строения деревни Духанино и ближайшего окружения в 1,9 раза выше среднего по региону для данной километровой зоны. Покупка здешней недвижимости обычно привлекает инвесторов , рассчитывающих на средний бюджет покупки. В целом Истринский район характеризуется значительным объёмом предложений недвижимости.
Совсем рядом находятся дачные участки «Флора», «Родник», «Алексино», «Кутасово», «Маяк», «Русь», «Малыш», «Автомобилист», «Ветеран», «Росинка», «Виктория», «Строитель-1», «Истра», «Пищемаш», «Пищемаш-2», «Рассвет». Округа деревни Духанино является настоящим дачным местом. Здесь разместились , по имеющимся данным, 30 дачных посёлков. Можно отметить, что по стоимости земельных наделов опережает других СНТ «Флора» ( рядом с дер. Адуево ). Добавим, что наиболее экономичными вариантами располагает СНТ «Минерал» ( что рядом с дер. Холмы ).
Не далее 15 км от деревни Духанино сосредоточена достаточно большая часть (приблизительно 8 % для Новорижского направления) посёлков коттеджей бизнес и эконом-класса. К слову, Новорижское направление на аналогичном радиусе от московского кольца содержит 64 - коттеджных застроек. Продвинутое соседство обусловлено коттеджными поселениями с собственными коммуникациями, в списке которых: «Дачное», «Духанино-2», «Связист», «WESTERN», «Дарна».
Из отчётности Роскадастра за 2013-2017 гг.:Превалирующая структура земельных участков - земли поселений, выделяемые для ЛПХ. Самая большая зафиксированная кадастровая оценка достигает 2 078 000,0 рублей за 10 соток. По данным кадастровой палаты, максимум сделок местных недвижимых объектов установлен в 2014, 2013 г. В основном происходили купли-продажи участков c незарегистрированными строениями, при самой крупной заявленной сумме купли-продажи - 3 905 000,0 руб./объект ( дом + участок 10 соток ). По площади участков, самыми востребованными стали габариты до 800 - 1000 кв.м и 12 - 15 соток. Срок нахождения в собственности объектов недвижимости до перехода прав обычно насчитывал больше трёх лет. Относительно продаж неосвоенных соток и владений c нерегистрированными домами, деревня с соседней округой ниже средне-статистического по Истринскому району значения.
Вблизи дер. Духанино (не далее 700 м) протекает река Песочная, общая длина которой насчитывает более, чем 28 километров, и которая является притоком р. Истра.
Также поблизости с деревней Духанино есть несколько водоёмов, в числе которых озеро Холмы, водохранилище Истринское. Более крупный водоём (водохранилище Истринское) имеет размер около 10.8 кв.км, располагается в 6.1 км северо-западее деревни, в направлении дер. Новораково, a у наиболее близкого (небольшой пруд, нет названия, располагается примерно в 900 м восточнее деревни, в направлении ДНП "Духанино-1") поперечный размер составляет где-то 90 м.
Духанино располагается всего в 3 -км от дороги A-107 (Московское Малое Кольцо). Ещё близкие к деревне трассы: Волоколамская и Новорижская.
К деревне Духанино подходит пути Большого кольца Московской железной дороги (БМО). Ближайшая станция («155 км») расположена в 4 километрах от деревни.