Названная деревня расположена на западе Московской области на расстоянии в 31 километр от Московского кольца.
Деревня отличается по численности населения на фоне соседних поселений. С деревней соседствуют село Дарна, посёлок Огниково, деревни: Холмы, Алексино, Адуево, Никольское, Сысоево. Рядом с деревней (в пределах километра) стоит дер. Сысоево. Среди них самое заселённое - пос. Огниково (проживает 162 жителей).
Районный административный центр - город Истра, стоит в 8,7 км к юго-западу от деревни Духанино.
В свою очередь, цены на недвижимость в деревне Духанино в 1,9 раза больше среднеобластного уровня для такой удалённости от Московской кольцевой автодороги. Предложения недвижимости в этой зоне более всего устраивает инвесторов , рассчитывающих на средний бюджет покупки. Общее количество предложений недвижимости по Истринскому району довольно значительно.
Поблизости располагаются дачные посёлки «Лотос», «Лотос», «Автомобилист», «Ветеран», «Малыш», «Юбилейный-110», «Сокольники-1», «Минерал», «Меркурий», «Березки-1», «Маяк», «Бонитет», «Истра», «Пищемаш», «Пищемаш-2», «Рассвет». Окружающие земли деревни Духанино являются воистину дачным уголком. Здесь обустроено по крайней мере 30 дачных кооперативов. Следует отметить, что по стоимости земельных наделов опережает других СНТ «Флора» ( около дер. Алексино ). В свою очередь, самыми недорогими можно поинтересоваться в СТ «Минерал» ( что около пос. Огниково ).
Не далее 15 км от деревни Духанино размещено достаточно большое количество (примерно 8 % для этого направления) коттеджных посёлков бизнес и эконом-класса. На сегодня Новорижское направление на аналогичном радиусе от Москвы демонстрирует 64 - посёлков коттеджей. Перспективное соседство представлено коттеджными посёлками с современными коммуникациями, в том числе: «Связист», «Духанино-2», «Дачное», «Дарна», «WESTERN».
По данным Роскадастра за 2013-2017 гг.:Распостранённый тип участков - территории поселений с правом применения для личного подсобного хозяйства. Максимальная учтённая кадастровая цена земли достигает 1 246 800,0 рублей за 6 соток. По отчётам портала услуг регистрации и кадастра, наибольшее количество продаж местной недвижимости установлен в 2014, 2013 г. Главным образом преобладали купли-продажи землевладений c несданными в эксплуатацию объектами, при самой крупной задекларированной сумме покупки - 3 905 000,0 руб./объект ( дом + участок 10 соток ). По величине земельных объектов, самыми востребованными можно определить участки до 8 - 10 соток и 12 - 15 соток. Срок нахождения в собственности недвижимости до отчуждения как правило насчитывал свыше трёх лет. По количеству сделок купли-продажи свободных участков и участков c несданными в эксплуатацию объектами, деревня с соседним окружением не доходит до среднего по Истринскому району значения.
Вблизи дер. Духанино (не далее 700 м) протекает река Песочная, общая длина которой насчитывает более, чем 28 километров, и которая является притоком р. Истра.
Также поблизости с деревней Духанино есть несколько водоёмов, в числе которых озеро Холмы, водохранилище Истринское. Более крупный водоём (водохранилище Истринское) имеет размер около 10.8 кв.км, располагается в 6.1 км северо-западее деревни, в направлении дер. Новораково, a у наиболее близкого (небольшой пруд, нет названия, располагается примерно в 900 м восточнее деревни, в направлении ДНП "Духанино-1") поперечный размер составляет где-то 90 м.
К дер. Духанино можно подъехать по трассе A-107 (Московское Малое Кольцо), находящейся в 3 -км. Другим путём, до деревни можно добраться по шоссе: Волоколамское и Новорижское.
Доехать до деревни Духанино также можно по железнодорожной линии БМО. Ближайшая станция («155 км») расположена в 4 километрах от деревни.