Расположенная на западе области, деревня отдалена на 31 км от московской окружной дороги.
В радиусе 7 километров от деревни расположены меньшие по размеру населённые пункты. В 7-ти километровой зоне от деревни располагаются село Дарна, посёлок Огниково, деревни: Алексино, Адуево, Холмы, Сысоево, Никольское. В непосредственной близости от деревни располагается дер. Сысоево. По числу проживающих среди упомянутых выделяется пос. Огниково (проживает 162 жителей).
Административным центром является город Истра, расположенный в 8,7 километрах к юго-западу от деревни Духанино.
Цены на земли и строения деревни Духанино и ближайшего окружения в 1,9 раза выше среднего по региону для данной километровой зоны. Покупка здешней недвижимости обычно привлекает клиентов , интересующихся предложениями в ближайшем Подмосковье. Стоит отметить, что количество предлагаемой к продаже загородной недвижимости по Истринскому району довольно значительно.
Совсем рядом расположены дачи СНТ «Комплект», «Виктория», «Росинка», «Алексино», «Родник», «Флора», «Русь», «Маяк», «Истра-ЗВИ», «Полесье», «Никольское», «Минерал», «Меркурий», «Березки-1», «Маяк», «Бонитет». Территория в округе деревни Духанино является классическим дачным уголком. Здесь, в 7-км зоне, обустроено всего 30 дачных посёлков. Из них по стоимости земельных наделов выделяется СТ «Флора» ( около дер. Алексино ). С другой стороны, более дешёвыми предложениями располагает СНТ «Минерал» ( что около пос. Огниково ).
В округе деревни Духанино возведено достаточно большое число (примерно 8 % для этого шоссе) коттеджных поселений бизнес и эконом-класса. В настоящий момент Новорижское шоссе на таком радиусе от московского кольца предлагает 64 - коттеджных посёлков. Продвинутое окружение обеспечено коттеджными комплексами с городской инфраструктурой, среди которых: «Дачное», «Духанино-2», «Связист», «WESTERN», «Дарна».
По сведениям кадастрового портала (2013-2017):Превалирующая структура земельных участков - территории поселений, предназначенные для личных подсобных хозяйств. Самая большая зафиксированная кадастровая цена земельных участков находится на уровне 2 078 000,0 руб./10 соток. По отчётам Роскадастра, пик сделок купли-продаж местных недвижимых объектов отмечен в 2014, 2013 г. В основном превалировали покупки землевладений c несданными в эксплуатацию объектами, при самой большой задекларированной цене договора - 3 905 000,0 руб./объект ( дом + участок 10 соток ). По площади участков, самыми популярными стали площади в пределах 8 - 10 соток и 1200 - 1500 кв.м. Срок нахождения во владении объектов недвижимости до продажи в основном составлял свыше трёх лет. По количеству реализаций неосвоенных участков и участков c объектами незавершённого строительства, деревня с соседним окружением не дотягивает до среднего по Истринскому району уровня.
Вблизи дер. Духанино (не далее 700 м) протекает река Песочная, общая длина которой насчитывает более, чем 28 километров, и которая является притоком р. Истра.
Также поблизости с деревней Духанино есть несколько водоёмов, в числе которых озеро Холмы, водохранилище Истринское. Более крупный водоём (водохранилище Истринское) имеет размер около 10.8 кв.км, располагается в 6.1 км северо-западее деревни, в направлении дер. Новораково, a у наиболее близкого (небольшой пруд, нет названия, располагается примерно в 900 м восточнее деревни, в направлении ДНП "Духанино-1") поперечный размер составляет где-то 90 м.
Рядом с дер. Духанино (в 3 -км) находится магистраль A-107 (Московское Малое Кольцо). Иначе до деревни можно добраться по трассам: Волоколамская и Новорижская.
Добраться до деревни Духанино можно по Большому кольцу Московской железной дороги. До ближайшей железнодорожной станции «155 км» приблизительно четыре километра.