Данная деревня расположена в северо-западной части региона на удалении в 19 км от столицы.
Ближайшие к деревне населённые пункты: село Озерецкое, посёлок совхоза "Останкино", деревни: Рыбаки, Мышецкое, Бабаиха, Глазово, Акишево. Ближайшим к деревне поселением является дер. Рыбаки.
Административным центром является город Дмитров, расположенный в 36 километрах северо-восточнее деревни Агафониха.
Цены на недвижимость деревни Агафониха и окружающей местности больше в 1,2 раза среднего значения, соответствующей удалённости от Москвы. Данный сегмент недвижимости может представлять интерес для людей , рассчитывающих на средний бюджет покупки. Объём продавемых объектов недвижимости в Дмитровском районе можно отнести к среднему по области (в пределах 4 %).
Поблизости находятся дачные кооперативы «Оникс», «Озеро Долгое», «Нерское», «Земля», «Приозерье», «Изумруд», «Останкино», «Вьюнок», «Лотос-2», «Останкино-2 (с/к)», «Мышецкое», «Элпа-Регион», «Родник-2», «Озеро Круглое», «Озеро Нерское», «Озеро Круглое». Территория в округе деревни Агафониха выглядит самым настоящим дачным районом. Здесь расположено приблизительно 20 дачных посёлков. Из них по стоимости земельных участков опережает других ДК «Приозерский» ( вблизи дер. Рыбаки ). С другой стороны, менее дорогими участками можно поинтересоваться в СТ «Оникс» ( что вблизи дер. Бабаиха ).
В округе деревни Агафониха построена большая часть (приблизительно 39 % для данного направления) посёлков коттеджей элит и бизнес-класса. Вообще, Дмитровское шоссе на аналогичном расстоянии от МКАД демонстрирует 18 - коттеджных посёлков. Ликвидное окружение обеспечено коттеджными комплексами с городскими удобствами, среди которых: «Акварели», «Мечта», «Озеро Долгое», «Зеленый Оазис», «Удино Парк», «Заповедное Озеро», «Эдельвейс».
По сводкам из Росрегистрации (2013-2016):Основной тип земельных угодий - земли с/х назначения с правом применения для садово-огороднической деятельности. Самая большая установленная кадастровая стоимость участков доходит до 1 101 000,0 руб./10 соток. По отчётам Роскадастра, максимум сделок купли-продаж здешней недвижимости отмечен в 2014 г. Причём чаще случались реализации земельных участков c несданными в эксплуатацию объектами, при наибольшей объявленной сумме покупки - 2 350 000,0 руб./объект ( дом + участок 10 соток ). По величине участков, особенно предпочитаемыми стали габариты в пределах 8 - 10 соток. Период владения недвижимых объектов до отчуждения чаще составлял больше трёх лет. По числу продаж владений c объектами незавершённого строительства, местная земля чуть превосходит средний по Дмитровскому району результат.
В 2 -км от деревни пролегает магистраль Р-113. Иначе до деревни можно добраться по магистралям: A-107 и Дмитровская.
Добраться до деревни Агафониха можно по Большому кольцу Московской железной дороги. Железнодорожная станция «120 км» находится в 4 км от дер. Агафониха.